围绕山地特色作物种质与基因资源创新利用，在作物分子育种，辣椒功能基因组，基因工程技术，珍稀中药材、食用菌等农业主导产业细胞工程技术，农产品品质鉴定等研究领域确立重点研究方向，系统开展前沿应用技术研究；进行现代农业生物技术的试验、示范以及推广服务工作；承担院重点实验室的建设、运营和维护工作，包括各类仪器设备、实验材料购置及易制毒危险化学品购置、管理的全流程工作；重视并广泛开展与企业、科研单位、大专院校的科研交流与合作，指导和培养高素质应用基础研究型人才；负责各研究所实验检测；完成上级交办的其他工作。